Không xác định rõ doanh nghiệp trong KCX được miễn hay giảm những loại thuế nào và theo thời hạn nào — dẫn đến áp thuế sai trên hóa đơn trong nhiều tháng.
Cấu hình chế độ thuế linh hoạt theo KCN/KCX với ưu đãi thuế TNDN và GTGT tương ứng, tự động áp dụng trên hóa đơn theo đối tượng khách hàng.

